Category Archives: Literatur

literatur, pustaka, referensi

Digital Calculator for theoretical ethanol yield

ethanol yield
(source: http://www.nrel.gov/data/pix/Jpegs/17376.jpg)

Baca juga: Menghitung potensi bioetanol dari TKKS | Sirup gula dari TKKS


NREL, National Renewable Energy Laboratory dari negeri Paman Sam, menyediakan web calculator untuk menghitung hasil teoritik (theoritical yield) etanol dari biomassa lignosellulosa. Kalau Anda memiliki bahan baku biomassa dan ingin tahu berapa (secara teori) ethanol yang bisa dihasilkan dari biomassa itu, Anda bisa mencoba fasilitas ini. Silahkan kunjungi: http://www1.eere.energy.gov/biomass/ethanol_yield_calculator.html.
Berikut ini contoh perhitungan dari theoritical yield ethanol dari tandan kosong kelapa sawit (TKKS). Datanya saya peroleh dari literaturnya Law et al. (2007). Law et al. (2007) menganalisis TKKS lengkap sekali, termasuk kandungan gula (C5 dan C6)-nya. Kalau data dari Law et al. (2007) ini dimasukkan hasilnya sangat menarik sekali. Ini hasil dari calculatornya NREL:

179,4 gallon/ton bahan baku kering

atau kurang lebih

679 liter/ton bahan baku kering.

Hasil ini lebih tinggi dari semua bahan baku yang dicontohkan oleh NREL di websitenya (ada di bagian bawah calcultor).
Continue reading

Irpex lacteus, Jamur Pelapuk Putih yang punya banyak manfaat

This slideshow requires JavaScript.

Informasi biologi Irpex lacteus
(sumber: http://www.messiah.edu/Oakes/fungi_on_wood/poroid%20fungi/species%20pages/Irpex%20lacteus.htm)

Irpex lacteus adalah salah satu jamur pelapuk putih yang banyak diteliti. Jamur ini memiliki banyak sekali manfaat. Salah satu artikel yang membahas secara detail tentang manfaat jamur ini ditulis oleh Novotný. Artikel yang sangat menarik. Jika Anda tertarik dengan jamur ini, silahkan baca artikelnya di link ini: Irpex lacteus.

Scientific name: Irpex lacteus (Fr.:Fr.) Fr.
Derivation of name: Irpex means “a large rake with
iron teeth”; lacteus means “milky.”
Synonymy: Polyporus tulipiferae (Schw.) Overh.
Common names: Milk-white toothed polypore.
Phylum: Basidiomycota
Order: Polyporales
Family: Steccherinaceae
Occurrence on wood substrate: Saprobic; on dead
branches of deciduous trees; year-round.
Dimensions: Caps (when present) 1-4 cm wide.
Upper surface: Growth entirely resupinate to effused-
reflexed; caps (when present) whitish, drying yellowish;
velvety hairy.
Pore surface: White to cream, dingy yellow in age; tubes
breaking up into flattened teeth up to 6 mm long.
Edibility: Inedible.
Comments: The brackets often fuse to form long rows.
The caps may be very small in comparison to the spreading,
resupinate portions of this fungus.


(Photo © Gary Emberger.)
Continue reading

ZOTERO: Management Referensi Online

Saya mengenal Zotero karena dikenalkan oleh Roni Irnawan. Awalnya hanya saling sharing tetang program referensi manajemen yang biasa kita gunakan. Sebelum ini saya biasa menggunakan JabRef sebagai ganti Endnote yang muahal banget. JabRef dan Zotero sama-sama program aplikasi untuk mengelola referensi yang free. Masing-masing memiliki kelebihannya sendiri. Kali ini saya ingin sharing tentang Zotero.

Zotero merupakan Add-on broser Mozilla Firefox. Kita bisa menginstallZotero langsung dari menu Add-on Firefox. Cara installnya mudah sekali, begitu juga cara penggunaannya. Kelebihan dari Zotero adalah dapat langsung menyimpan sitasi dari website yang sedang kita buka. Tidak dipungkiri kalau orang lebih sering mencari referensi dari internet dengan menggunakan browser, perpaduan Firefox dan Zotero merupakan perpaduan yang luar biasa dan sangat powerfull. Apalagi ditambah dengan add-in untuk Google Schollar, Zotero menjadi lebih bermanfaat sekali.

Perhatikan tutorial bagai mana mudahnya menggunakan Zotero untuk management referensi berbasis internet.


Continue reading

Biofuel

biofuelBiofuel menjadi salah satu topik yang hangat saat ini. Kebutuhan akan energi terbarukan sudah sangat mendesak sekali. Banyak pilihan biofuel dan energi alternatif lainnya, seperti: bioethanol, biodiesel, butanol, metanol, energi angin, energi gelombang laut, dan lain-lain. Buku ini membahas tentang biofuel dari berbagai sisi. Buku yang cukup bagus untuk dibaca dan menambah pengetahuan kita tentang biofuel. Silahkan didownload di link ini: Biofuel.

biofuel download free ebook
Download buku dan referensi lain: Klik Di Sini.

Silahkan didownload resources yang mungkin Anda perlukan juga:

Handbook on BIOETHANOL: Production and Utilization

handbook bioethanol download freeSalah satu buku yang cukup berguna tentang bioethanol adalah buku yang Handbook on BIOETHANOL: Production and Utilization. Buku memang sudah cukup kuno, tetapi isinya tetap relefan untuk saat ini. Editor buku ini adalah Prof Charles Wyman. Salah satu pentolan NREL untuk bioethanol selulosa. Banyak sekali literatur yang sudah ditulis oleh Prof. Wyman. Beliau juga menjadi editor jurnal Biotechnology for Biofuel.

Silahkan disedot dan dipelajari bukunya ini: Handbook on Bioethanol: Production and utilization.

Download buku dan referensi lain: Klik Di Sini.


DOWNLOAD

Silahkan didownload resources yang mungkin Anda perlukan juga:

Daftar bahan lain yang bisa didownload: Download Di Sini
Cara mendownload: Klik dua kali pada link yang akan didownload. Kemudian ikuti perintah selanjutnya. Kalau ada iklan yang muncul, klik aja iklannya atau langsung ke SKIP ADD yang ada di pojok kanan atas.

Prosedur Pengukuran Aktivitas Enzyme Cellulase-IUPAC

Prosedur standard pengukuran aktivitas enzyme selulase (cellulase) IUPAC. Metode ini diadopsi juga oleh NREL. Silahkan didownload di link ini Aktivitas Enzyme Cellulase.

Prosedur pengukuran enzyme cellulase standard NREL.

Download buku dan referensi lain: Klik Di Sini.

Prosedur Analisis Aktivitas Enzyme Xylanase -IUPAC

Prosedur pengukuran aktivitas enzyme xylanase IUPAC. Silahkan didownload di link ini Aktivitas Enzyme Xylase IUPAC.

Metode analisa aktivitas enzyme xylanase yang lain silahkan download di sini: Aktivitas Enzyme Xylanase

Download buku dan referensi lain: Klik Di Sini.

ANALISA AKTIVITAS ENZIME LIGNINOLITIK (revised)

Download manual ini dalam format pdf: Metode Analisa Enzyme Ligninolitik
Lihat juga metode dari Sigma Aldrich : Peroxidase Assay

Download buku dan referensi lain: Klik Di Sini.


Baca metode penelitian dari jurnal kadang-kadang bisa membuat pening kepala. Apalagi ketika baru pertama mau mulai dan tidak punya dasar-dasarnya. Bisa tidak mudheng sama sekali. Sama seperti saya waktu pertama kali mau analisa enzyme, mesti buka-buka texbook dan catatan lama, plus tanya sana-sini. Setelah itu baru sedikit ngeh. Saya bagikan prosedur ini untuk temen-temen yang mungkin membutuhkannya. Metodenya tidak mesti persis sama seperti yang saya uraikan di sini, yang penting tahu apa yang dilakukan dan bisa menghitungnya. Semoga bermanfaat.


Catatan:

Beberapa hal yang perlu diperhatikan pengukuran aktivitas enzyme.
1. Ekstraksi enzyme dan analisa mesti dilakukan pada hari yang sama. Aktivitas enzyme bisa cepat berubah jika disimpan. Jika Anda akan mengukur aktivitas enzyme ligninolitik, mesti segera dilakukan setelah ekstraksi enzyme. Penyimpanan dalam lemari pendingin atau dibekukan akan menghasilkan aktivitas enzyme yang berbeda.

2. Resep di bawah ini bisa saja dimodifikasi dengan mengatur komposisinya agar absorbansinya di antara 0 dan 1. Jika absorbansinya lebih dari 1, encerkan larutan enzymenya.

3. Waktu jeda analisa juga bisa disesuaikan dengan kebutuhan. Waktu bisa dikurangi atau ditambah hingga data absorbansinya cukup terbaca antara 0 dan 1.

A. Ekstrasi Enzyme

Ekstraksi Enzym dengan metode sentrifugasi (Gassara, Brar et al. 2010):
1. Satu gram sample dicampur dengan buffer phosphate 50mM pH 6,5 dengan perbandingan 10/1 (v/w).
2. Kemudian dishaker pada kecepatan 150 rpm selama 1 jam.
3. Setelah itu sampel disentrifugasi pada kecepatan 7000xg selama 20 menit.
4. Supernatan cair dipisahkan dan digunakan untuk analisa aktivitas enzyme.

Metode ini bisa dimodifikasi, langkah ke-2 diganti dengan digerus pada kondisi dingin. Pengerusan dilakukan dengan mortar dan letakan es disekitar mortar tersebut.Hasil gerusan kemudian disaring dan filtratnya disentrifugasi seperti cara di atas.

B. Pengukuran Aktivitas Enzyme

B.1. Laccase (Lac)

Pada cuvet masukkan:
– 0,5 buffer asetat pH5 0,5 M
– 0,1 ml ABTS 1 mM
– 0,4 ml filtrate enzim
Volume total 1 ml. Tabung/cuvet dikocok perlahan agar semua bahan tercampur.
Reaksi aktvitas enzyme dilakukan pada suhu 20±1 oC.
Absorbansi diukur pada waktu 0 dan beberapa menit (5 atau 10 menit, atau lebih lama lagi) pada panjang gelombang  420 nm.

Rumus perhitungan:

Aktivitas enzyme (U/ml) = (∆OD420 x Vtot (ml) x 10^9)/(εmax x d x Vol enzyme (ml) x t)

ε maks = absorpsivitas molar ABTS (36000 M-1 cm-1)
Continue reading

Suprasturktur Lignin Peroksidase, Enzim Pendegradasi Lignin

Lignin peroksidase (LiP) adalah salah satu enzim yang dapat memecah lignin. Enzim ini umumnya dihasilkan oleh jamur pelapuk putih. Berikut ini model struktur lignin peroksidase.

jamur pelapuk putih
Jamur pelapuk putih yang menghasilkan LiP

LIGNIN: Struktur Kimia Lignin

Lignin merupakan salah satu komponen lignoselulosa yang banyak diteliti. Beberapa usulan model struktur kimia lignin telah dikembangkan oleh beberapa ahli. Berikut ini struktur lignin yang pernah diusulkan.

lignin structure freudeberg
Freudenberg (1965)

Glasser and Glasser (1974)

lignin structure alder
Alder (1977)

lignin struktur brunow
Brunow et al. (1998)

Vanholme R. et.al. Plant Physiol. 2010:153:895-905


Usulan struktur model lignin yang terbaru dari Vanholme 2010

Referensi Lignin: Lundquist and Parkås (2011). Different types o phenolic units in lignins. Bioresourses 6(2), 920-926
Artikel tentang kimia lignin yang ditulis oleh Knut Lundquist bisa dilihat di sini: Lignin Lundquist.


Referensi yang berkaitan:
cellulosic cell wall